Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARBP10826 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARBP10826 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARBP10826 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARBP10826 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARBP10826 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RARBP10826 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARBP10826 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARBP10826 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARBP10826 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARBP10826 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARBP10826 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RARBP10826 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARBP10826 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RARBP10826 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARBP10826 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARBP10826 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms