Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APODP05090 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APODP05090 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APODP05090 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APODP05090 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APODP05090 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APODP05090 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APODP05090 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APODP05090 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APODP05090 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APODP05090 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APODP05090 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APODP05090 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APODP05090 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APODP05090 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APODP05090 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms