Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDF1O60869 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDF1O60869 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDF1O60869 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EDF1O60869 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDF1O60869 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDF1O60869 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDF1O60869 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDF1O60869 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDF1O60869 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDF1O60869 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms