Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC11O43248 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC11O43248 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC11O43248 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms