Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFIT3O14879 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFIT3O14879 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFIT3O14879 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFIT3O14879 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFIT3O14879 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFIT3O14879 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms