Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3KR12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3KR12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3KR12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3KR12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3KR12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3KR12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3KR12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3KR12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3KR12 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3KR12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3KR12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3KR12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3KR12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3KR12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3KR12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3KR12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3KR12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
J3KR12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3KR12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms