Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1P1A8MUH7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1P1A8MUH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms