Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms