Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1W2PQJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms