Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPK6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPK6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A096LPK6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A096LPK6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A096LPK6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms