Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087X0B3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A087X0B3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087X0B3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms