Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO6Q9UM54 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYO6Q9UM54 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYO6Q9UM54 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms