Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR1Q9UKL0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RCOR1Q9UKL0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCOR1Q9UKL0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms