Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3AQ9NVI7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms