Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms