Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms