Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOD2Q9HC29 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD2Q9HC29 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD2Q9HC29 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD2Q9HC29 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD2Q9HC29 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD2Q9HC29 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD2Q9HC29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms