Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC94Q9BW85 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms