Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED9Q9BVK6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms