Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSG1Q9BU20 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms