Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNGAP1Q96PV0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms