Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNBD2Q96M20 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms