Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E2Q96LR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms