Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLMNQ96JQ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLMNQ96JQ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms