Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16BQ96JE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16BQ96JE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms