Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC35A4Q96G79 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms