Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CELF1Q92879 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF1Q92879 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms