Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PELI3Q8N2H9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PELI3Q8N2H9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms