Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFCDQ8IXH7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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