Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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