Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms