Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms