Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA1Q15788 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NCOA1Q15788 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA1Q15788 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms