Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTCH1Q13635 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms