Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN5Q08AF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms