Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFF3Q07654 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms