Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms