Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A1P68400 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms