Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HERVK_113P62684 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113P62684 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms