Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24CP53992 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms