Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP2P46087 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP2P46087 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP2P46087 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP2P46087 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP2P46087 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP2P46087 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP2P46087 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP2P46087 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP2P46087 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP2P46087 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP2P46087 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP2P46087 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP2P46087 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP2P46087 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP2P46087 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP2P46087 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP2P46087 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms