Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGEA4P43358 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms