Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNFP41002 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNFP41002 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNFP41002 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNFP41002 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNFP41002 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNFP41002 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNFP41002 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNFP41002 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNFP41002 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNFP41002 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNFP41002 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNFP41002 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNFP41002 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNFP41002 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNFP41002 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNFP41002 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNFP41002 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNFP41002 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNFP41002 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNFP41002 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNFP41002 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNFP41002 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNFP41002 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNFP41002 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNFP41002 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms