Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT2P35908 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT2P35908 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT2P35908 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT2P35908 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT2P35908 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT2P35908 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT2P35908 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT2P35908 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT2P35908 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT2P35908 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT2P35908 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT2P35908 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT2P35908 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT2P35908 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT2P35908 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT2P35908 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT2P35908 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT2P35908 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT2P35908 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT2P35908 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT2P35908 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT2P35908 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT2P35908 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms