Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 SNT2YGL131C 4212 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 PDC1YLR044C 1692 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 GAS2YLR343W 1668 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 KRS1YDR037W 1776 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 LDB17YDL146W 1476 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 ENT2YLR206W 1842 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 HSF1YGL073W 2502 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 NOT3YIL038C 2511 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YDR249CYDR249C 1122 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 POS5YPL188W 1245 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YPR195CYPR195C 330 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 TOS4YLR183C 1470 nt4.88□□□□□ -1.63
SEF1P34228 MBP1YDL056W 2502 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 PSE1YMR308C 3270 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YDR053WYDR053W 396 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 DAN1YJR150C 897 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 POM33YLL023C 840 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 ATG33YLR356W 594 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YBR016WYBR016W 387 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SUI3YPL237W 858 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SRB6YBR253W 366 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 ARN1YHL040C 1884 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YDL109CYDL109C 1944 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YBR139WYBR139W 1527 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 PMT5YDL093W 2232 nt4.87□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YHR045WYHR045W 1683 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 PRM7YDL039C 2097 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 ARD1YHR013C 717 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SPG4YMR107W 348 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 RPT2YDL007W 1314 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 COQ6YGR255C 1440 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YHR182WYHR182W 2358 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 MUP3YHL036W 1641 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SAS10YDL153C 1833 nt4.86□□□□□ -1.63
SEF1P34228 JAC1YGL018C 555 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YGL101WYGL101W 648 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 CIA2YHR122W 696 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 HPM1YIL110W 1134 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 NDJ1YOL104C 1059 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SER1YOR184W 1188 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 VHS2YIL135C 1311 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 HST1YOL068C 1512 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 DED81YHR019C 1665 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 UTP18YJL069C 1785 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SEO1YAL067C 1782 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 MKS1YNL076W 1755 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 MPH2YDL247W 1830 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YFL034WYFL034W 3222 nt4.85□□□□□ -1.63
SEF1P34228 GDB1YPR184W 4611 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 TUP1YCR084C 2142 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SEC39YLR440C 2130 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 HPC2YBR215W 1878 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 NRD1YNL251C 1728 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 THI21YPL258C 1656 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 TRM8YDL201W 861 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 SIP2YGL208W 1248 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YJL068CYJL068C 900 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 MRT4YKL009W 711 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YKR047WYKR047W 306 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 LTO1YNL260C 597 nt4.84□□□□□ -1.63
SEF1P34228 GRS1YBR121C 2004 nt4.84□□□□□ -1.64
SEF1P34228 VID30YGL227W 2877 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 RFT1YBL020W 1725 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 NOC4YPR144C 1659 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ARG4YHR018C 1392 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YDR134CYDR134C 411 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 MTQ2YDR140W 666 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 PAD1YDR538W 729 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YFR035CYFR035C 345 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ARO2YGL148W 1131 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YIL060WYIL060W 435 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 RCL1YOL010W 1104 nt4.83□□□□□ -1.64
SEF1P34228 SEC12YNR026C 1416 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YEL074WYEL074W 339 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 SUA5YGL169W 1281 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ECT1YGR007W 972 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 SPO16YHR153C 597 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 RPB4YJL140W 666 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 RER2YBR002C 861 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 BUB3YOR026W 1026 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YNG1YOR064C 660 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 MRI1YPR118W 1236 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YEL077CYEL077C 3834 nt4.82□□□□□ -1.64
SEF1P34228 BDP1YNL039W 1785 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ZRC1YMR243C 1329 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 PEX19YDL065C 1029 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 CNL1YDR357C 369 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 DUO1YGL061C 744 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 PCT1YGR202C 1275 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YLR374CYLR374C 390 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YIM2YMR151W 438 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 SFT2YBL102W 648 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 VPS28YPL065W 729 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ESF1YDR365C 1887 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 STE20YHL007C 2820 nt4.81□□□□□ -1.64
SEF1P34228 TMN2YDR107C 2019 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ASK10YGR097W 3441 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ADE3YGR204W 2841 nt4.8□□□□□ -1.64
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