Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5A1P25705 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms