Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCP20941 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCP20941 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCP20941 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCP20941 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCP20941 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCP20941 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCP20941 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCP20941 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCP20941 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCP20941 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDCP20941 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDCP20941 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCP20941 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCP20941 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCP20941 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCP20941 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCP20941 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCP20941 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCP20941 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms