Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RLBP1P12271 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLBP1P12271 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms