Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGKV1-13P0DP09 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGKV1-13P0DP09 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms