Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFLP07196 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFLP07196 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFLP07196 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFLP07196 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFLP07196 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFLP07196 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFLP07196 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFLP07196 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFLP07196 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFLP07196 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFLP07196 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFLP07196 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFLP07196 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFLP07196 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFLP07196 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFLP07196 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFLP07196 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFLP07196 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFLP07196 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFLP07196 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFLP07196 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFLP07196 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFLP07196 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFLP07196 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms